32. Translace genové informace#
V předchozí úloze jste se naučili vybrat z genové informace trojice, které kódují jednotlivé aminokyseliny. Nyní tuto informaci přeložíme na seznam aminokysein.
Pro překlad je možné použít následující slovník.
table = {
'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M',
'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT':'T',
'AAC':'N', 'AAT':'N', 'AAA':'K', 'AAG':'K',
'AGC':'S', 'AGT':'S', 'AGA':'R', 'AGG':'R',
'CTA':'L', 'CTC':'L', 'CTG':'L', 'CTT':'L',
'CCA':'P', 'CCC':'P', 'CCG':'P', 'CCT':'P',
'CAC':'H', 'CAT':'H', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q',
'CGA':'R', 'CGC':'R', 'CGG':'R', 'CGT':'R',
'GTA':'V', 'GTC':'V', 'GTG':'V', 'GTT':'V',
'GCA':'A', 'GCC':'A', 'GCG':'A', 'GCT':'A',
'GAC':'D', 'GAT':'D', 'GAA':'E', 'GAG':'E',
'GGA':'G', 'GGC':'G', 'GGG':'G', 'GGT':'G',
'TCA':'S', 'TCC':'S', 'TCG':'S', 'TCT':'S',
'TTC':'F', 'TTT':'F', 'TTA':'L', 'TTG':'L',
'TAC':'Y', 'TAT':'Y', 'TAA':'_', 'TAG':'_',
'TGC':'C', 'TGT':'C', 'TGA':'_', 'TGG':'W',
}
Vše je nastaveno jako v předchozí úloze. Genová informace je v proměnné text
. Doplňte řešení předchozí úlohy a získaný seznam tripletů převeďte pomocí zadané tabulky na seznam (list
) aminokyselin. Výsledek uložte do proměnné seznam_aminokyselin
. (Použijte například zkrácenou generátorovou notaci)
# Predchozi priklad
text = "GGTCAGAAAAAGCCCTCTCCATGTCTACTCACGATACATCCCTGAAAACCACTGAGGAAGTGGCTTTTCAGATCATCTTGCTTTGCCAGTTTGGGGTTGGGACTTTTGCCAATGTATTTCTCTTTGTCTATAATTTCTCTCCAATCTCGACTGGTTCTAAACAGAGGCCCAGACAAGTGATTTTAAGACACATGGCTGTGGCCAATGCCTTAACTCTCTTCCTCACTATATTTCCAAACAACATGATGACTTTTGCTCCAATTATTCCTCAAACTGACCTCAAATGTAAATTAGAATTCTTCACTCGCCTCGTGGCAAGAAGCACAAACTTGTGTTCAACTTGTGTTCTGAGTATCCATCAGTTTGTCACACTTGTTCCTGTTAATTCAGGTAAAGGAATACTCAGAGCAAGTGTCACAAACATGGCAAGTTATTCTTGTTACAGTTGTTGGTTCTTCAGTGTCTTAAATAACATCTACATTCCAATTAAGGTCACTGGTCCACAGTTAACAGACAATAACAATAACTCTAAAAGCAAGTTGTTCTGTTCCACTTCTGATTTCAGTGTAGGCATTGTCTTCTTGAGGTTTGCCCATGATGCCACATTCATGAGCATCATGGTCTGGACCAGTGTCTCCATGGTACTTCTCCTCCATAGACATTGTCAGAGAATGCAGTACATATTCACTCTCAATCAGGACCCCAGGGGCCAAGCAGAGACCACAGCAACCCATACTATCCTGATGCTGGTAGTCACATTTGTTGGCTTTTATCTTCTAAGTCTTATTTGTATCATCTTTTACACCTATTTTATATATTCTCATCATTCCCTGAGGCATTGCAATGACATTTTGGTTTCGGGTTTCCCTACAATTTCTCCTTTACTGTTGACCTTCAGAGACCCTAAGGGTCCTTGTTCTGTGTTCTTCAACTGTTGAAAGCCAGAGTCACTAAAAATGCCAAACACAGAAGACAGCTTTGCTAATACCATTAAATACTTTATTCCATAAATATGTTTTTAAAAGCTTGTATGAACAAGGTATGGTGCTCACTGCTATACTTATAAAAGAGTAAGGTTATAATCACTTGTTGATATGAAAAGATTTCTGGTTGGAATCTGATTGAAACAGTGAGTTATTCACCACCCTCCATTCTCT"
seznam_pocatky_trojic = range(???,???,???)
seznam_tripletu = [text[i:i+???] for i in seznam_pocatky_trojic]
# Prekladova tabulka
table = {
'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M',
'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT':'T',
'AAC':'N', 'AAT':'N', 'AAA':'K', 'AAG':'K',
'AGC':'S', 'AGT':'S', 'AGA':'R', 'AGG':'R',
'CTA':'L', 'CTC':'L', 'CTG':'L', 'CTT':'L',
'CCA':'P', 'CCC':'P', 'CCG':'P', 'CCT':'P',
'CAC':'H', 'CAT':'H', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q',
'CGA':'R', 'CGC':'R', 'CGG':'R', 'CGT':'R',
'GTA':'V', 'GTC':'V', 'GTG':'V', 'GTT':'V',
'GCA':'A', 'GCC':'A', 'GCG':'A', 'GCT':'A',
'GAC':'D', 'GAT':'D', 'GAA':'E', 'GAG':'E',
'GGA':'G', 'GGC':'G', 'GGG':'G', 'GGT':'G',
'TCA':'S', 'TCC':'S', 'TCG':'S', 'TCT':'S',
'TTC':'F', 'TTT':'F', 'TTA':'L', 'TTG':'L',
'TAC':'Y', 'TAT':'Y', 'TAA':'_', 'TAG':'_',
'TGC':'C', 'TGT':'C', 'TGA':'_', 'TGG':'W',
}
# Seznam aminokyselin
# seznam_aminokyselin = ... doplnte